Program pendidikan Mutiara Harapan Islamic School telah dirancang untuk membimbing siswa menjadi  warga Muslim terbaik, yang secara sadar menyembah Allah (SWT) serta selalu mengaplikasikan nilai-nilai Islam; menurut ajaran Al-Qur’an dan Al-Sunnah Nabi Muhammad (SAW).

Kurikulum yang dirancang MHIS meluas di seluruh tingkat kelas, meningkatkan kompleksitas dan tingkat penguasaan setiap tahun. Guru berusaha keras untuk membantu siswa lintas bidang kurikulum memberikan pengalaman yang merangsang pembelajaran di semua bidang perkembangan – spiritual, fisik, sosial, emosional dan intelektual – melalui pendekatan pembelajaran yang terintegrasi.